Центральное таможенное управление:

•   Центральный офис

•   Брянское обособленное подразделение

Северо-западное таможенное управление:

•  Санкт-Петербургское обособленное подразделение

Сибирское таможенное управление

•   Иркутское обособленное подразделение

Дальневосточное таможенное управление:

•   Дальневосточное обособленное подразделение

Таможни центрального подчинения:

•   Обособленное подразделение Шереметьево

•   Домодедовское обособленное подразделение